Синсаку Такасуги и Когоро Кацура, перемещенные в альтернативную версию Японии из-за действий Мугэнсая, завершают разбирательство с временными параллелями и готовятся к возвращению в свою эпоху. Однако устройство, известное как «хронометр», которое считалось уничтоженным, проявляет самостоятельную активность и начинает восстанавливаться. Процесс восстановления сопровождается образованием опасных разломов в пространстве, через которые в текущий мир проникают фрагменты из других реальностей,