Пятеро детей оказываются на древнем острове после нападения врагов. Остров населён двумя типами дигимонов: звериным и человеческим. В этом месте, как и в остальном Цифровом мире, идёт война между этими группами за права и территории. Дети замечают, что один дигимон звериного типа и один человеческого типа смогли подружиться, несмотря на конфликт. Это наблюдение становится отправной точкой для их дальнейших действий. Друзья принимают решение прекратить междоусобицу, которая мешает обеим сторонам

Кэйта Суминоэ готовится к поступлению в старшую школу. Его родители выбрали для него академию Гакусю, в которой уже учатся его старшие сёстры-близняшки Ако и Рико. Сёстры испытывают к брату чувства, выходящие за рамки родственных отношений. Они рады предстоящему поступлению Кэйты и намерены приложить усилия, чтобы он успешно сдал вступительные экзамены. Поддержка сестёр принимает формы, которые выходят за пределы обычной помощи с учёбой. Их активные действия создают для Кэйты дополнительные

Неожиданно началась эпидемия: умершие стали восставать, и Япония погрузилась в хаос. В старшей школе монстры начали атаковать учеников, и Такаши Кимуро был вынужден убить своего лучшего друга, когда тот был укушен и превратился в ходячего мертвеца. Пообещав защищать Рей Миямото, девушку погибшего друга, они с трудом выбрались из школы, оказавшись в обществе, которое уже рухнуло. Такаши и Рей объединяются с другими учениками, чтобы найти своих родственников и выяснить причину пандемии. К ним