В современном мире был создан виртуальный мир, зовущийся Цифровым. Дигимоны — обитатели этого мира — живут тут и радуются жизнью. Но внезапно мир обернулся в хаос. Причина тому — Иггдрасиль, создатель всего живого в виртуальности, который разработал «X-программу». Её целью является уничтожение всех и вся, дабы на месте этого мира создать новый, специально для одного-единственного существа. Однако на это самое существо открыли охоту «Королевские рыцари» — приспешники Иггдрасиля и защитники

На протяжении веков магический и человеческий миры жили в мире друг с другом, хотя физически были разделены магическими вратами. Но когда могущественные магические сферы украдены и падают на Землю, король магии посылает Босса, бойца, Лайма, мастера-трансформера, и Пуги, мастера-морфера, чтобы вернуть их. У троицы не так много времени, и она должна вернуть сферы, которые при контакте с миром людей поглощают негативные эмоции предметов домашнего обихода и превращаются в бэмов, пучеглазых монстров!

В некотором городе, под названием Нью-Йорк, коварный Шреддер вместе со своими приспешниками, членами клана «Фут», организовал полномасштабный режим террора. И воцарились хаос и ужас среди мирного населения. Но для всякого зла найдётся противоборствующая сила. Из тени канализационных шахт, словно гром среди ясного неба, объявляется четвёрка смельчаков-мутантов, внешне похожих на черепах. Используя свои ум, силу, сплоченность и даже знания боевых искусств, отряд борцов за справедливость вступает