Tomorou Tenma possesses a uniquely strong e-Pulse—the energy created by human thoughts and emotions that powers egg-shaped AI devices named Sapotama. The world's everyday life relies on the assistance of Sapotamas, but the force of Tomorou's e-Pulse often causes glitches in them. One night, a strange creature calling itself Gekkoumon emerges from his device and insists on eating Tomorou's e-Pulse. Gekkoumon is a Digimon, a creature feeding on e-Pulse that was born from an error

Такато Мацуда, обычный школьник, в свободное время любит поиграть с друзьями в карточную игру про дигимонов. Играют в неё не только при помощи карт, но и специального устройства, которое после загрузки карты повышает определённые характеристики дигимона. После очередной партии Такато обнаружил у себя в наборе новую, синюю карту. Активировав её, он получил дигивайс, а вместе с ним — дигимона по имени Гилмон. Вскоре, герои знакомятся с ещё двумя обладателями дигивайсов — Цзянь Лян Ли и Руки

В центре города X City расположена X Tower, объединенное сооружение из двух небоскребов. Здание служит официальной штаб-квартирой профессиональных бейбэттлов, где участники соревнуются за право подняться на все сто этажей. На вершине башни действующие чемпионы, команда Pendragon, ожидают соперников для защиты своего титула. Блейдер-любитель Берд Бёрд Кадзами приезжает в город с целью стать профессионалом. В первом отборочном матче его команда терпит поражение, после чего товарищи Берда

Через год после событий «Бейблэйд: Взрыв GT» братья Хикару Асахи и Хьюга становятся свидетелями невероятной силы Суперкинг/Спаркинг эволюций Валькирии, Рагнарёка и Сатана. Три бейблэйда излучают мощь, которую невозможно было даже представить, — и всё благодаря тому, что их владельцы совершают спаркинг-запуск. Вдохновлённые увиденным, Хьюга и Хикару решают создать собственные спаркинг-бейблэйды, Гиперион и Гелиос, чтобы сразиться с легендарными блэйдерами, тренируясь превзойти лучших из лучших,