Прямое продолжение Da Capo II. На этот раз зрители увидят больше знакомых героев из первого сезона. Становится ясно, что все девушки искренно влюблены в Дзюнъити [朝倉純一]. Это приводит к тому, что Сакура [芳乃さくら] пробуждает магическую сакуру и неосторожно загадывает желание. Жизнь героев переворачивается с ног на голову, и теперь им надо найти способ вернуть всё назад.

На первый взгляд Мамору Кагэмори — неряшливый парень с растрёпанными волосами, носящий очки с толстыми линзами. Но в действительности он является наследником династии ниндзя. Его семья 400 лет тайно защищала своих соседей, семью [[Конняку]]. У Мамору персональное поручение: защищать дочь соседей, Юну Конняку [紺若 ゆうな], ещё со времён детского сада. Когда Юна попадает в беду, Мамору надевает костюм ниндзя и превращается в идеального бойца, чтобы защитить её.

Продолжение истории острова Хацунэ и его вечно цветущей сакуры. Прошло 53 года с событий первой части. Главный герой Ёсиюки [桜井義之] живёт по соседству с сёстрами Отомэ [朝倉音姫] и Юмэ [朝倉由夢], которые приходятся внучками Дзюнъити и Нэму из первого сезона. Вся история вертится вокруг магического дерева сакуры, исполняющего желания. Прошли годы, и дерево начало исполнять все желания, независимо от того, хорошие они или нет. Главным героям предстоит разобраться с этим и спасти Хацунэдзиму.

Некогда остров Хацунэ был известен вишнёвыми деревьями, цветущими независимо от времени года. Два года назад вишнёвые деревья острова утратили свою примечательную особенность и стали самыми обычными деревьями, цветущими только весной. Живущий на острове старшеклассник Дзюнъити Асакура [朝倉純一] учится в академии Кадзами и окружён друзьями, как новыми, так и старыми. В дождливый летний день у двери дома Дзюнъити появляется загадочная девушка по имени Аисия [アイシア]. Она разыскивает бабушку Сакуры

Город Хацунедзима известен своими невянущими вишневыми деревьями, которые, по слухам, исполняют самые искренние желания. Также ходят разговоры о людях со сверхъестественными способностями, например, о Дзюнъити Асакуре, который умеет видеть чужие сны и создавать сладости из ничего. Вместе со своей сестрой Нэму он ведет спокойную жизнь в академии Кадзами, но скрывает свои способности от окружающих. Размеренная школьная жизнь Дзюнъити нарушается, когда он узнает о возвращении своей подруги детства