Сюжет аниме разворачивается вокруг Кумаширо Маи, дочери бывшего директора Академии Валдштейн, и путешественника во времени Фумиаки Учиды. В 2012 году Земля подверглась вторжению пришельцев, и несколько временных агентов были отправлены в прошлое, в 1999 год, с целью найти и уничтожить объект под названием Ключ Нострадамуса. Согласно предсказаниям Нострадамуса, этот объект должен вызвать апокалипсис. Действие сериала происходит в 1999 году. Мая возвращается в Академию, намереваясь уничтожить её,

Кохэй Хасэкура, 17-летний подросток, из-за работы родителей сменил более двадцати школ и привык избегать близких отношений с людьми. После переезда родителей за границу он решает начать всё заново и переводится в академию-пансионат Сютикан, где учился семь лет назад. Учебное заведение расположено на отдалённом острове Тамацу, добраться до которого можно только по морю. Сразу после перевода Кохэй сталкивается с несколькими ученицами: сёстрами Канадэ и Харуной Юки, с которыми дружил в детстве,

Юдзуру Отонаси приходит в себя в незнакомом месте, не помня ни своего имени, ни обстоятельств своей смерти. Вскоре он встречает школьницу Юри Накамуру, которая утверждает, что он умер, и предлагает присоединиться к организации под названием «Фронт загробного мира». В руках Юри находится винтовка, направленная на другую девушку, которую она называет «ангелом». Юдзуру вмешивается, чтобы предотвратить выстрел, и обращается к предполагаемому «ангелу» с вопросами о происходящем. Девушка