Шиничи Кудо — семнадцатилетний школьник, прозванный окружающими за свои способности «Современным Шерлоком Холмсом». Однажды вечером после свидания с подругой детства Ран Шиничи становится свидетелем преступления мафии. Его замечают мафиози, ловят и заставляют принять странную пилюлю... Придя в себя, он обнаруживает, что стал семилетним ребёнком. Отныне у Кудо будет новая жизнь! А чтобы сбить со следа тех, кто отравил его, Шиничи переезжает жить к Ран, отец которой руководит детективным

Кэнсин Химура [緋村 剣心] — бродяга с тёмным прошлым и израненной душой. Бывший наёмник в период реставрации Мэйдзи, он бродит по миру и помогает людям в надежде искупить содеянное. Спустя 11 лет после реставрации Мэйдзи Кэнсин оказывается в Токио, где помогает девушке Каору Камии [神谷 薫] защитить её наследственное додзё от бандитов. Каору, зная о прошлом Кэнсина, позволяет тому остаться. И постепенно, не без помощи Химуры, в додзё собираются сирота Яхико [明神 弥彦], кулачный боец Саносукэ [相楽佐之助] и

Прошёл год. Идзуми [泉 拓人] и Нандзё [南條 晃司] вместе, но сомнения всё больше одолевают их. Идзуми приглашают в профессиональную лигу в Италии, и он уезжает на неделю, чтобы посмотреть на «настоящую игру», не успев сказать об этом. Нандзё пускается за ним на мотоцикле и попадает в серьёзную аварию, состояние критическое. Вернувшись обратно в Японию, Идзуми узнаёт, что Нандзё возможно уже никогда не очнётся... Но это только начало испытаний.

Год 0079 Вселенского Века. После успеха операции «Одесса» всё больше солдат Федерации направляют на Землю, дабы освободить захваченные Зионом области. Младший лейтенант Широ Амада — как раз один из таких солдат — получает назначение возглавить 8-ой взвод, команду наземных Гандамов. Основная цель взвода — отвлечение противника и поиск нового таинственного оружия Зиона. Однако во время транспортировки к месту назначения Широ оказывается втянут в сражение, в котором встречает красавицу Айну

Хадзимэ [金田一 一], Миюки [七瀬 美雪] и инспектор Кэммоти [剣持 勇] приглашены на церемонию открытия «Дома Оперы». Там они узнают, что в честь открытия будет показана новая постановка «Призрака оперы». Но очень скоро таинственный «Призрак» начинает убивать участников труппы одного за другим. Хадзимэ придётся снова раскрывать дело об убийство в «Доме Оперы».