Бейблэйд представляет собой игру, где участники запускают вращающиеся волчки с целью выбить волчок соперника из игровой зоны. Исход поединка определяется скоростью и массой запущенных блэйдов. На основе этой игры организуется турнир, победитель которого получает звание лучшего блэйдера. В числе участников соревнования находится Джинга Хаганэ, молодой игрок. Его блэйд обладает характеристиками, связанными с образом Пегаса. Джинга настроен на достижение победы в турнире, что является его основной
Действие происходит в Токио в 2020 году. В компьютерной сети обнаруживаются сбои, которые проявляются в виде неполадок светофоров и помех на экранах. В новостях эти события связывают с возможной кибератакой. Пятиклассник Таити Ягами остается дома один, готовясь к поездке в летний лагерь. Его мать и младшая сестра Хикари находятся в поезде, который останавливается в районе Сибуи из-за технических проблем. Таити отправляется к ним, но по пути неожиданно перемещается в цифровое пространство,